深圳贝赛思福田双语学校在课程体系上与蛇口贝赛思国际学校存在显著差别，这些差异主要体现在课程体系、教材使用以及教学语言上。

在课程体系方面，福田贝赛思双语学校在1到9年级的义务教育阶段，结合了中国国家课程和BASIS课程。进入高年级后，则采用BASIS课程与AP课程相结合的模式，学生需在十年级后方能正式接触AP课程。相较之下，蛇口贝赛思国际学校则主打BASIS课程与AP课程，其低年级课程旨在为高年级的AP课程奠定基础。

教材使用上，福田贝赛思作为民办学校，其核心学科以中文教材为起点，实行中英双语教学。而蛇口贝赛思作为纯外籍人员子女学校，在教材选用和教学规划上拥有更多自由，更贴近美国贝赛思的教育体系。

至于教学语言，福田贝赛思采用中英双语教学，其中中文占15%、英文占75%、双语教学占10%，对学生的日常用语没有特定要求。而蛇口贝赛思除了中文课程外，全部采用英文授课，并要求学生在校园内的日常交流也使用英语，以营造全英文的学习环境。